溫州市實時熒光定量PCR儀標準
發(fā)布時間：2022-06-12 01:38:11
溫州市實時熒光定量PCR儀標準
化驗室診斷方法- -般采用的檢測依據(jù)為國家標準、農(nóng)業(yè)標準，其次是有關(guān)動物疫病檢測的其它技術(shù)規(guī)程、規(guī)范等，還可以采用化驗室自行設(shè)定的檢測方法。應結(jié)合化驗室條件及樣品類型等因素來選擇合適的方法。例如，化驗室需診斷偽狂犬病，如果沒有基因擴增儀，但有酶標儀，就可以采用酶聯(lián)免疫吸附試驗診斷，而不必用聚合酶鏈反應試驗診斷。使用化驗室自行設(shè)定的檢驗方法要慎重,因為，一該檢驗方法是否正確有待驗證;二如果將來有爭議.上訴法院，會有較大的麻煩。
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熱啟動Taq酶產(chǎn)品優(yōu)勢;1. 靈敏度高：可直接擴增1個拷貝的支原體DNA。2. 化學修飾，無動物性DNA污染。3. 性價比高：相對市面上zui常用的熱啟動聚合酶性價比更高。4. 擴增效率高：熒光定量PCR起峰快，Ct值低，擴增效率高。5. 可重復性高：熒光定量PCR擴增曲線重合度高，受干擾影響少。熱啟動Taq酶應用：1. 熱啟動PCR 2. 熒光定量PCR 3. DNA序列測定4. TA cloning.
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常規(guī)普通PCR常見問題：1. 優(yōu)化反應條件，梯度摸索退火溫度，延長退火延伸時間，增加反應循環(huán)數(shù)（30-45區(qū)間為宜）。2. 對核酸模板進行純化，或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進行提取，增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應體系（預混體系除外），改變檢測體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量，更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計引物，避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級結(jié)構(gòu)，在一次稀釋引物后可分裝成多支小管，減少反復凍融次數(shù)。
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在PCR反應早期，產(chǎn)生熒光的水平不能與背景明顯地區(qū)別，而后熒光的產(chǎn)生進入指數(shù)期、線性期和終的平臺期，因此可以在PCR反應處于指數(shù)期的某一點 上來檢測PCR產(chǎn)物的量，并且由此來推斷模板初的含量。為了便于對所檢測樣本進行比較，在real-time Q-PCR反應的指數(shù)期，首先需設(shè)定一定熒光信號的域值，一般這個域值（threshold）是以PCR反應的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號 （baseline），熒光域值的缺省設(shè)置是3～15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認為是真 正的信號，它可用于定義 樣本的域值循環(huán)數(shù)（Ct）。Ct值的含義是：每個反應管內(nèi)的熒光信號達到設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明，每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的 對數(shù)存在線性關(guān)系，起始拷貝數(shù)越多，Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標準品可作出標準曲線，因此只要獲得未知樣品的Ct值，即可從標準曲線上計算出該樣 品的起始拷貝數(shù)。
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熱啟動PCR（hot start PCR）是指使Taq DNA 聚合酶只有在樣品溫度至少超過70℃時才發(fā)揮作用的PCR，可提高反應的特異性。Taq DNA 聚合酶通常在比適宜溫度低得多的條件下仍有較強的活性。PCR 反應的初加熱過程中，樣品溫度上升到70℃之前，在較低的溫度下引物可能與部分單鏈模板形成非特異性結(jié)合，并在Taq DNA 聚合酶的作用下延伸。結(jié)果會導致非靶序列的擴增，影響反應的特異性。熱啟動可減少非靶序列的擴增，提高反應的特異性。在引物設(shè)計時如果某位點因為遺傳元件的定位而受限，如site-directed 突變、表達克隆或用于DNA 工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作等情況，熱啟動PCR 尤為有效。